美國俄勒岡健康與科學(xué)大學(xué)的一個臨床實驗室團隊希望通過為俄勒岡州所有成年人提供免費的遺傳性癌癥和家族性高膽固醇血癥基因篩查來改變該州居民的這種狀況。自2018年起，該團隊篩查了13000多名當(dāng)?shù)鼐用?，近日他們在《美國人類遺傳學(xué)雜志》上介紹了此次研究的方法、發(fā)現(xiàn)和經(jīng)驗教訓(xùn)。
(資料圖片)
早期基因檢測可以改善癌癥預(yù)后，但如果缺乏家族史或負擔(dān)不起檢測費用，人們通常不會接受這種篩查。“我們希望這次的研究可以作為其他想要進行低成本人口篩查的州的一個模型?！闭撐牡谝蛔髡逿imothy O’Brien說，“我們提供了一種路線圖，讓未來的篩查項目可以看看哪些是有效的，哪些可以改進?！?/p>
該團隊通過社交媒體廣告和農(nóng)貿(mào)市場等活動招募參與者，他們還設(shè)置了自動售貨機，人們可以在那里取回和歸還收集漱口水唾液樣本的測試包。在新冠大流行暴發(fā)后，個人可以通過郵件申請檢測試劑盒。一旦參與者通過一個符合健康保險流通與責(zé)任法案（HIPAA）的應(yīng)用程序表示同意，樣本就會在臨床實驗室進行處理，以篩選與遺傳性癌癥相關(guān)的31個基因和與家族性高膽固醇血癥相關(guān)的1個基因中的致病變異。
“我們希望報告任何被認(rèn)為是可操作的致病變異，這意味著你可以對此做些什么，比如改變你的習(xí)慣，進行預(yù)防性手術(shù)或藥物治療，或者咨詢臨床醫(yī)生。”論文通訊作者、俄勒岡健康與科學(xué)大學(xué)分子與醫(yī)學(xué)遺傳學(xué)榮譽教授Sue Richards說。
研究者在13000多名參與者中發(fā)現(xiàn)，有710人的一種致病變異篩查呈陽性。所有確認(rèn)陽性結(jié)果的參與者都會接到遺傳咨詢師的電話，解釋他們的結(jié)果，以及該結(jié)果如何影響他們的疾病風(fēng)險和醫(yī)療管理的建議。
“遺傳咨詢對這個項目至關(guān)重要?！盧ichards說，“公眾不容易理解這些基因檢測報告，因為它們的技術(shù)含量相當(dāng)高，僅僅攜帶致病變異并不意味著他們會患上那種癌癥。咨詢師不僅會告訴他們自己的健康狀況和家族史，還會告訴他們?nèi)绾螌⑦@些信息傳遞給其他家庭成員，因為他們也有攜帶這種變異的風(fēng)險?！?/p>
當(dāng)實驗室團隊第一次開始這個項目時，他們不得不將實驗室的基因檢測工作流程擴大到原有能力的10倍左右，方法是專注于一組選定的致病變異，并通過機器人的幫助執(zhí)行更繁瑣的任務(wù)。這使得該小組可以每月用1名實驗室技術(shù)人員處理1000個樣本，估計每位參與者的成本為50美元。為了減少實驗室混淆導(dǎo)致假陽性的可能性，所有陽性結(jié)果的參與者都被要求使用不同的基因測序方法進行二次篩查。最終，研究人員報告說，在他們測序的20000個樣本中，沒有臨床相關(guān)的樣本混淆。
根據(jù)測序結(jié)果，研究人員還收集了大量數(shù)據(jù)，可用于分析俄勒岡州人口的遺傳風(fēng)險因素，并進行額外的研究。大約5%的參與者在一種致病的遺傳性癌癥變異篩查中呈陽性，這一比例高于之前幾項人群篩查研究報告的結(jié)果，這可能是因為有個人或家族癌癥病史的人更有可能尋求檢測。
這種高于預(yù)期的患病率也可能是因為先前的研究篩選了一組不同的基因。美國醫(yī)學(xué)遺傳學(xué)和基因組學(xué)學(xué)院（ACMG）詳細列出了一組與個人狀況無關(guān)的基因，但建議在進行臨床測試的患者中對其進行分析。然而，如果只檢查這個列表中的基因，他們將錯過研究人群中59%的致病變異。此外，研究中發(fā)現(xiàn)的最常見致病變異并不在ACMG的清單上。這突出表明，在大型篩查研究中，擴大被檢測基因的范圍可以對獲得陽性結(jié)果的人數(shù)產(chǎn)生重大影響。
該團隊計劃在未來繼續(xù)他們的篩查項目，并加大努力，以覆蓋更多樣化的參與者群體。目前，76%的研究參與者是女性，因此該團隊正在研究如何招募更多的男性參與者。此外，通過將他們使用的應(yīng)用程序翻譯成西班牙語，研究人員打算接觸更多俄勒岡州講西班牙語的人口。
“這個項目的總體目標(biāo)是真正幫助俄勒岡人，讓他們掌握這些健康信息。”O(jiān)’Brien說，“我們覺得已經(jīng)能夠?qū)崿F(xiàn)這一目標(biāo)，并希望它在未來繼續(xù)成為俄勒岡人健康的有力支持者?！?/p>
相關(guān)論文信息：
http://doi.org/10.1016/j.ajhg.2023.06.014
標(biāo)簽：
