術(shù)后檢測?穿刺活檢?在手術(shù)前,甲狀腺結(jié)節(jié)的良性惡性難分辨。西湖大學(xué)教授郭天南團隊將高通量蛋白質(zhì)組學(xué)與Al技術(shù)結(jié)合,診斷準確率提高到85%以上。
(資料圖)
9月6日,西湖大學(xué)郭天南研究員團隊、李子青教授團隊及臨床合作者在學(xué)術(shù)期刊《細胞發(fā)現(xiàn)》(Cell Discovery)雜志上發(fā)表論文“Artificial intelligence defines protein-based classification of thyroid nodules”,利用人工智能結(jié)合蛋白質(zhì)表達檢測,精準診斷甲狀腺的良惡性,從而幫助醫(yī)生判斷結(jié)節(jié)是否需要切除。
近年來,甲狀腺結(jié)節(jié)的患病率持續(xù)高升,普通人群中的甲狀腺結(jié)節(jié)患病率高達50%,即每2個成年人中就有1個人可能患有甲狀腺結(jié)節(jié)。
數(shù)據(jù)顯示,其中大概只有10%是惡性的。也就是說,大部分良性甲狀腺結(jié)節(jié)患者原本可以選擇保守治療而不是切除。
在臨床評估中,通常采用細針穿刺活檢方式,獲取結(jié)節(jié)的組織樣本來進行細胞病理診斷。即便如此,仍然有多達1/3的甲狀腺結(jié)節(jié)無法準確分類。
在郭天南等人發(fā)表的最新研究中,科研人員使用壓力循環(huán)技術(shù),可以實現(xiàn)在微量組織樣本上進行蛋白質(zhì)組學(xué)分析。
研究人員基于1724例石蠟包埋(FFPE)的甲狀腺組織,尋找到19個蛋白質(zhì)生物標志物,并建立模型——一個神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)模型。實驗結(jié)果表明,該模型在對甲狀腺結(jié)節(jié)良惡性的判斷準確率超過91%。
為了驗證該模型的性能,研究人員對來自中國的288個樣本進行測試,其診斷結(jié)果的準確率為89%。從新加坡、中國的12個臨床中心收集到的另外294份樣本顯示,驗證結(jié)果準確率為85%。
在甲狀腺結(jié)節(jié)分子診斷中,基于核酸(DNA與RNA)的輔助診斷方法已是一項較為成熟的技術(shù)。但RNA易降解,給檢測帶來了挑戰(zhàn)。
同時,用于不確定性結(jié)節(jié)良惡性判別的突變目前仍存爭議,因此限制了其應(yīng)用。
相比之下,從蛋白質(zhì)分子層面進行分析就會可靠得多。當發(fā)生病變時,病變部位的狀態(tài)可以直接地從蛋白質(zhì)分子層面顯示出來。
但由于蛋白質(zhì)組的數(shù)據(jù)十分繁雜,研究人員的工作量會變得十分龐大,AI的加入恰好解決了這一問題,它的計算速度和準確性使得研究人員分析蛋白質(zhì)組數(shù)據(jù)的過程變得輕松很多。
郭天南教授也認為,如果可以將大健康與AI結(jié)合起來,不管從學(xué)術(shù)角度、從生物學(xué)原理的必要性角度,還是從市場、社會的需求來說,都將是時代的大趨勢。
參考資料
1. Artificial inteligence defines protein-based classification of thyroid nodules.Cell.
2. 郭天南|人工智能+蛋白質(zhì)組學(xué):藥物研發(fā)的生物學(xué)底層變革.智藥邦.
https://mp.weixin.qq.com/s/HO3BCZix8vhhf1ZENv2Ndg
3. Proteomic and Metabolomic Characterization of COVID-19 Patient Sera.Cell.
https://www.cell.com/cell/fulltext/S0092-8674(20)30627-9
4. Multi-organ Proteomic Landscape of COVID-19 Autopsies.Cell.
https://www.cell.com/cell/fulltext/S0092-8674(21)00004-0